氯己定含漱液制剂不宜长期使用的原因主要是长期使用可能会使口腔黏膜表面与牙齿着色，还可能会使舌苔发黄、味觉改变，还可能导致口腔菌群失调。
氯己定含漱液制剂的主要成分是葡萄糖酸氯己定、甲硝唑，辅料是甘油、聚山梨酯-80、聚乙二醇-400、色素等。其中含有的葡萄糖酸氯己定属于广谱杀菌剂，甲硝唑有抗厌氧菌作用，可以清洁口腔，还能杀灭口腔内部致病菌，辅助治疗冠周炎、牙龈炎、口腔黏膜溃疡、牙周脓肿等疾病。
由于氯己定含漱液制剂中的主要成分是抗菌药物，如果自己随意使用或者使用时间太长，可能会影响到口腔内的正常菌群，导致口腔菌群失调。另外由于该药物中含有一定的色素成分，长期使用还可能会导致口腔黏膜及牙齿着色，也可能会导致味觉丧失，一般停药后可恢复。因此不建议长期使用，应遵医嘱短期使用。
每个人的口腔问题不同，出现口腔或牙齿病变时要尽早就诊于口腔科，通过医生视诊、口腔病理检查后，在医生指导下进行干预治疗，有利于炎症消除。
